健康监测系统的设计须遵循功能要求和效益—成本分析两大准则。

监测系统的设计首先应该考虑建立该系统的目的和功能，健康监测三方面内容（结构监控与评估、设计验证和研究、发展）的意义也正是结构健康监测的目的和功能所在。对于特定结构，建立健康监测系统的目的可以是结构监控与评估，或是设计验证，甚至以研究发展为目的。一旦建立系统的目的确定，系统的监测项目就可以基本确定。另外，监测系统中各监测项目的规模以及所采用的传感仪器和通信设备等的确定需要考虑投资的限度。因此在设计监测系统时必须对监测系统方案进行成本—效益分析。根据功能要求和成本—效益分析可以将监测项目和测点数设计到所需的范围，可以最优化地选择并安装系统硬件设施。

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